Во-первых, команда биоинформатиков из Gene Solutions использовала полногеномное бисульфитное секвенирование (WGBS) на пяти типах опухолевых тканей (рак молочной железы, колоректальный рак, рак желудка, печень и легкие) и парных лейкоцитов (WBC) для создания опухолеспецифического метилирования. атлас (TSMA), где обнаружено 2945 областей CpG между типами опухолей и лейкоцитами. Затем команда реализовала модель глубокого обучения графовой сверточной нейронной сети, которая объединяет оценки деконволюции из TSMA с другими функциями для достижения улучшенной точности прогнозирования происхождения опухоли в наборе проверочных данных из 239 образцов вкДНК малой глубины.
Повышая точность идентификации опухолей с помощью метода, основанного на искусственном интеллекте, исследование открывает множество перспектив при применении в тестах на раннее выявление нескольких видов рака:
Повышенная точность данных: Комбинация продемонстрировала исключительную эффективность в точном определении происхождения опухоли, в частности, точность до 100%, 98% и 93% для рака молочной железы, печени и колоректального рака.
Уменьшенная глубина секвенирования: Имея направляющий атлас, группа исследований и разработок может оптимизировать глубину секвенирования, необходимую для идентификации опухолей, что делает его более эффективным и экономичным. Такое сокращение глубины секвенирования не только ускоряет получение результата, но и экономит дорогостоящие ресурсы для секвенирования следующего поколения.
Ресурсы для оптимизированного анализа: Подход, основанный на искусственном интеллекте, оптимизирует использование вычислительных ресурсов, сокращая общие затраты и время, необходимые для анализа опухолей. Эта оптимизация является важным шагом на пути к тому, чтобы сделать расширенный анализ ДНК циркулирующих опухолей доступным и доступным как для медицинских работников, так и для пациентов.
Доктор Минь Дуй Фан, ведущий автор исследования, прокомментировал: «Аналитическая проверка нового атласа метилирования опухолей и алгоритма глубокого обучения знаменует собой важную веху в анализе циркулирующей ДНК опухолей для раннего обнаружения сигналов рака. Используя возможности искусственного интеллекта, мы повышаем точность и эффективность технологии раннего обнаружения множественных видов рака для ее практического использования».
Будущие разработки:
Благодаря дальнейшему развитию нашей команды данных Gene Solutions стремится расширить возможности TSMA. Продолжающиеся усилия в области исследований и разработок направлены на обеспечение более качественного анализа и его применения в реальной практике, чтобы снизить стоимость анализов, гарантируя, что передовые инструменты скрининга рака будут доступны для рекомендованных людей во всем мире.
Для получения более подробной информации об исследовании и TSMA посетите https://spotmas.com/blog/pioneering-a-tumor-specific-methylation-atlas-tsma-to-identify-tissue-of-origin-too. -при раннем выявлении множественного рака/
Ссылки:
Нгуен, TH, Доан, NNT, Тран, TH и др. Обнаружение происхождения ткани раковой опухоли с использованием образцов вкДНК малой глубины посредством сочетания опухолеспецифического атласа метилирования и полногеномной плотности метилирования в графовых сверточных нейронных сетях. Джей Трансл Мед 22, 618 (2024), doi: 10.1186/s12967-024-05416-z
Хэштег: #GeneSolutions
Эмитент несет полную ответственность за содержание настоящего объявления.
О генных решениях:
Gene Solutions, новаторская компания по генетическому тестированию в Юго-Восточной Азии, расширяет возможности принятия решений в области здравоохранения, предоставляя доступную и важную информацию. Их услуги включают тесты секвенирования нового поколения (NGS), которые поддерживают репродуктивное здоровье и клиническую онкологию. Gene Solutions специализируется на неинвазивном пренатальном скрининге (NIPT), мониторинге минимальной остаточной болезни (MRD), жидкой биопсии мультигенной панели, комплексном геномном профилировании (CGP) и тестах на раннее выявление нескольких видов рака (MCED). Используя клинически проверенные методы анализа бесклеточной ДНК и приложения искусственного интеллекта в биоинформатике, компания стремится обеспечить точную медицину. Имея сеть из шести лабораторий NGS, отвечающих международным стандартам, в Юго-Восточной Азии, Gene Solutions остается в авангарде инновационных генетических решений.