15 марта отмечено Международный день распространения информации о постковидном синдроме . По оценкам, это изнурительное состояние затрагивает по меньшей мере 65 миллионов человек и ежегодно увеличивается, создавая растущее бремя здравоохранения в размере более 1 триллиона долларов США во всем мире.

Постковидный синдром разнообразие Общие черты с миалгическим энцефаломиелитом/синдромом хронической усталости (МЭ/СХУ), сложным хроническим заболеванием, характеризующимся глубокой усталостью, которая не уменьшается в покое и ухудшается при физической или умственной активности. Оба состояния трудно диагностировать и лечить из-за большого количества различных симптомов заболевания и пораженных органов.

Однако Несмотря на Они оказывают огромное воздействие на личность и общественное здоровье, у нас до сих пор нет инструментов для точной диагностики пациентов и нет лекарств, которые лечат основные причины заболеваний. Это привело к широко распространенному непониманию, недостаточной осведомленности и даже отрицанию болезней в клинических и социальных сообществах, что еще больше вредит больным.

Британская компания точной медицины Технология PrecisionLife использует искусственный интеллект и комбинаторная аналитика найти более глубокие генетические ассоциации, чем Традиционные методы анализа позволяют подробнее рассказать о том, как сложные заболевания проявляются у пациентов, и выявить скрытые закономерности в многомерных и сложных данных о пациентах. Это может привести к прорывам в диагностике, разработке лекарств и точной медицине.

Недавно я познакомился с соучредителем и генеральным директором PrecisionLife Стивом Гарднером на Глобальный саммит Hevolution по здравоохранению в Эр-Рияде, где он поделился идеями компании и их успехами в привлечении новых идей для помощи в диагностике и лечении постковидного синдрома и других сложных хронических заболеваний.

Трансформация понимания болезней с помощью расширенной аналитики данных

Подход PrecisionLife, основанный на искусственном интеллекте, выходит за рамки традиционных полногеномных ассоциативных исследований (GWAS), выявляя комбинации генетических и негенетических факторов, которые вызывают заболевание в различных подгруппах пациентов.

Садовник объясняет технологическую основу компании:

«С технологической точки зрения мы переосмысливаем то, как вы анализируете данные, и это действительно Зарождение компании — объединение двух наборов технологий. Одну, которую я разрабатывал в течение последних 20 лет, а другую, мой соучредитель, математик и специалист по информатике, разрабатывал еще дольше — на самом деле 30 лет.

Мы поняли, что если мы объединим эти две вещи, у нас действительно будет способ работать с этими сверхсложными, большими наборами данных пациентов со всей геномной информацией, всей мультиомикой, протеомикой, эпигенетикой и всем остальным, и соотносить их с такими вещами, как продольные электронные медицинские карты (EMR) или электронные медицинские карты (EHR), а также эпидемиологическую и экологическую информацию».

Ученые стали свидетелями трансформации в развитии онкологических заболеваний:

«Это превратилось из органоопосредованного диагноза в молекулярную характеристику Опухоли и тонкая палитра вариантов для клинициста на выбор на основе состава конкретных типов опухолей.

Я хотел сделать то же самое для всех тех болезней, которые не работали».

Это привело к тому, что компания занялась такими сложными заболеваниями, как болезнь Альцгеймера, долгосрочный COVID-19, шизофрения и эндометриоз — состояния, при которых существует не один ответственный ген, а скорее сеть генетических и негенетических компонентов, влияющих на риск, начало и прогрессирование заболевания.

Гарднер называет МЭ/СХУ «образцом тяжелых болезней».

По словам Гарднера, в этих заболеваниях есть много различных генетических компонентов, но также и негенетических компонентов, которые влияют, увеличивают риск, провоцируют заболевание и показывают, как это заболевание будет проявляться у отдельных пациентов.

«Достижение такого уровня понимания движущих сил биологии заболевания — и пациентов, для которых конкретный фактор был актуален и, следовательно, на какую терапию они могли бы реагировать — было не тем, что мы могли бы сделать с помощью традиционного генетического анализа, подходов, основанных на общегеномных исследованиях ассоциаций».

С тех пор компания применила эту методологию примерно к 60 различным заболеваниям, получив то, что Гарднер описывает как «ведущее в мире понимание многих из них».

В случае с постковидным синдромом Гарднер поделился:

«На сегодняшний день у нас нет утвержденной диагностики постковидного синдрома. У нас есть zОдобренные ERO методы лечения, модифицирующие болезнь. Мы даже не знаем, какие органы в организме задействованы у конкретного пациента.

Мы знаем, что он влияет на многие ткани, но мы мало знаем о нем».

Ключевым аспектом подхода PrecisionLife является то, что он основан на убеждении в том, что существует множество различных причин заболеваний у пациентов.

Пациентам может быть поставлен один и тот же диагноз только потому, что их симптомы кажутся похожими, например, у всех есть усталость, но это не значит, что их болезни одинаковы.

Таким образом, препараты, которые приносят пользу одному пациенту, могут не работать у другого, если причина их заболевания (механизм заболевания) отличается.

Гарднер объясняет: «Мы создаем биомаркеры стратификации пациентов, чтобы обеспечить точную медицинскую аналитику по десяткам хронических заболеваний».

Серия ключевых генетических открытий в области COVID, Long COVID и МЭ/СХУ

PrecisionLife использовала свою платформу комбинаторной аналитики для совершения значительных генетических открытий, связанных с COVID, длительным COVID и СХУ/МЭ:

• В 2020 году он Определены 68 новых генов-мишеней, связанных с тяжелым COVID-19, из них 70 процент были позже подтверждены. В результате появилось 29 возможностей для одобренных препаратов и кандидатов, которые могут быть перепрофилированы в качестве средств для лечения COVID-19. Тринадцать из этих кандидатов в лекарства были оценены в клинических испытаниях.
• В 2022 году она предоставила первый Воспроизводимые генетические факторы риска для МЭ/СХУ за более чем 30 лет, идентификация 14 генов и 199 SNP объясняющий 91% изученных кейсов.
• В Середина 2023 года , PrecisionLife получил доступ к набору данных пациентов с длительным COVID GOLD от Sano Genetics. В нем рассматривались два набора

В Случай последнего , Гарднер подробно : «Мы идентифицировали более 5 000 SNP и 73 гена, связанных с постковидным синдромом. Это значительно больше, чем было обнаружено в любом другом исследовании на сегодняшний день, даже в тех, в которых было проанализировано более 50 000 пациентов.

. Девять из Гены также были найдены в исходных 14 генах из анализа ME/CFS.

Обнаружены первые в истории реплицированные генетические ассоциации для МЭ/СХУ и Long COVID

В настоящее время PrecisionLife сотрудничает с Фондом Metrodora и его институтом, расположенным в Солт-Лейк-Сити, штат Юта. Метродора был создан объединить исследователей, врачей и пациентов для быстрого совершенствования диагностика, лечение и исходы при сложных состояниях (таких как МЭ/СХУ и постковидный синдром.

PrecisionLife — это Запуск серии клинические исследования с участием 1 000 пациентов — 500 с МЭ и 500 с постковидным синдромом.

«Скорость и точность нашего прогресса в этих испытаниях поразительны», — сказал Гарднер.

«Мы идентифицировали и опубликовали первые в истории реплицированные генетические ассоциации в оба МЭ/СХУ и постковидный синдром».

Подробнее о Гарднере

«Мы начали возвращать результаты пациентам Metrodora на основе конкретных сигнатур риска заболевания у пациента и симптомов, которые он с наибольшей вероятностью испытает.

«Пациенты приходят к нам, и они говорят, что это гениально. Вы знаете, это первый раз, когда тест отразил мой личный взгляд на то, что идет не так в моей болезни. И клиницисты любят его, потому что он направляет их к корректирующей терапии».

По словам Гарднера, это открывает большие возможности для персонализированной медицины:

«Просто подумайте об этом: клинически подтвержденные новые мишени и возможность выбирать пациентов, которые получат пользу от препаратов, модулирующих эту мишень. Невероятно. Это похоже на исследование RECOVERY под руководством NHS по COVID-19, в котором был обнаружен дексаметазон, но на стероидах, потому что мы используем генетические данные для выбора наиболее перспективных методов лечения».

Далее, в прошлом месяце, партнерство успешно воспроизводимые ключевые генетические факторы риска для Long COVID в различных популяциях, подтверждено 88 процент ранее идентифицированных генов.

Это является самым убедительным генетическим доказательством Длинный COVID и поддерживает диагностику на основе биомаркеров и таргетное лечение.

Кроме того, 11 из 13 кандидатов на перепрофилирование лекарств были проверены, что открыло путь к клиническим испытаниям и персонализированной терапии.

Что интересно в работе PrecisionLife, так это ее потенциал во всех сферах разнообразие пространства в медицинских исследованиях.

Первоначально компания сосредоточилась на биофармацевтике, работая с фармацевтическими компаниями и контрактными исследованиями Организации (КИО) для выявления новых мишеней для лекарств.

Например, как подробно описал А.Г. Гарднер: «Когда вы видите одну и ту же мишень, лежащую в основе болезней на 30–40% основного рынка, это может дать возможность переключить существующий актив на новое показание. В этом есть реальная ценность».

Технология PrecisionLife также использует Генетическая диагностика для улучшения раннего выявления заболеваний и принятия клинических решений.

«Возьмем, к примеру, эндометриоз — требуется 8–10 лет, чтобы подтвердить диагноз хирургическим путем . Если Мы можем превратить это в буккальный мазок, который сообщит через две недели и точно направит пациента к врачу гинеколог Это меняет правила игры.

По отдельности эти достижения имеют решающее значение для пациентов. Но когда вы суммируете затраты на несвоевременную диагностику и неправильную классификацию , они становятся очень значимыми .»

Кроме того, идеи PrecisionLife могут оптимизировать сортировку пациентов, поделился Гарднер:

«Например, мы работаем с системой здравоохранения, где 5000 пациентов ежегодно направляются к ревматологу из-за неспецифического теста на АНА. Только 10 процентов на самом деле имеют ревматологическое заболевание. Это огромная проблема неправильной классификации, блокирующая систему».

Вместо того, чтобы строить свою владеть диагностического бизнеса, PrecisionLife лицензирует свои тесты и системы поддержки принятия решений для существующих инфраструктур здравоохранения.

«Мы не хотим строить огромный диагностический бизнес самостоятельно. Платформы, которые мы используем, являются стандартными и доступны по всему миру. Мы можем лицензировать контент и систему поддержки принятия клинических решений для проведения этих тестов на нескольких рынках. И что интересно, так это то, что он почти не зависит от болезни».

Эта модель обеспечивает масштабируемость, делая их технологию доступной для различных условий и рынков здравоохранения мировой .

Являются ли будущие «активно защитные» гены, которые защищают от болезней?

PrecisionLife является первопроходцем в новом подходе к профилактике заболеваний, выявляя «активно защитные» гены — генетические факторы, которые защищают уверенный лица с высоким риском развития заболеваний. Традиционно генетические исследования сосредоточены на выявлении мутаций, вызывающих заболевания , а вот это Новый метод переворачивает процесс, ища вместо этого людей, у которых должно было развиться заболевание, но которые остаются здоровыми, несмотря на высокий генетический риск и подверженность триггерам заболевания.

A Недавнее исследование на МЭ/СХУ идентифицировали девять белок-кодирующих генов с защитными эффектами, потенциально противодействуя известным механизмам заболевания, связанным с инсулином сигнализация , реакция на стресс и аутоиммунные заболевания.

Эти результаты открывают возможности для новых профилактических методов лечения, включая мишени для лекарств, которые действуют аналогично статинам и снижают уровень холестерина для предотвращения сердечных заболеваний.

Кроме того, некоторые из этих защитных генов могут быть использованы для лечения на основе мРНК с использованием той же технологии, что и вакцины против COVID-19, для повышения естественной устойчивости к болезням. Этот может привести к персонализированному защитному лечению, увеличению продолжительности здоровья и улучшению Качество жизни лиц с высоким риском перед болезнь когда-либо Развивается.

Ведущее изображение: Freepik.