В журнале опубликована новая статья Труды Королевского общества B использовали метабаркодирование ДНК окружающей среды (eDNA) для анализа сообществ рыб и зоопланктона.

Исследование показало, что движение воды между пресноводными водоемами или связь с пресной водой может транспортировать эДНК. Это подчеркивает потенциал эДНК для обеспечения комплексного представления о биоразнообразии пресноводной воды.

Водные экосистемы соединены водными путями, которые позволяют рыбам, растениям и другим организмам перемещаться из одного места в другое. Эта связь важна для устойчивости водных популяций, но она также может затруднить отслеживание ДНК этих организмов.

В исследовании, проведенном доктором Джоан Литтлфэр, преподавателем биологических наук в Лондонском университете королевы Марии, изучались три сети озер, включающие 21 озеро, в бореальном лесу Канады в районе экспериментальных озер МИУР.

Исследователи обнаружили, что эДНК внутри озера обычно отражает предпочтения вида в среде обитания, но некоторая часть эДНК также переносится в озера, расположенные ниже по течению. В озерах с более высокой степенью связности было обнаружено больше эДНК, что невозможно объяснить обычными методами мониторинга.

Полученные результаты имеют значение для использования эДНК для мониторинга биоразнообразия в пресноводных экосистемах. Электронная ДНК — многообещающий инструмент для мониторинга биоразнообразия, но данные необходимо интерпретировать с учетом взаимосвязанности ландшафта.

«ЭДНК может использоваться для обнаружения видов, которые сложно контролировать обычными методами, включая инвазивные виды, или для мониторинга присутствия редких или находящихся под угрозой исчезновения видов», — сказал доктор Литтлфэр.

«Наше исследование показало, что исследования eDNA могут быть тщательно разработаны с учетом связности изучаемой пресноводной системы. В системах с высоким уровнем связности важно собирать образцы из нескольких мест, что позволит нам построить полную картину настоящее биоразнообразие».

Исследование также подчеркивает необходимость дополнительных исследований таких факторов, как влияние движения воды, влияющих на пространственное разрешение обнаружения эДНК. Например, если вода в экосистеме движется быстро, возможно, потребуется собрать больше образцов, чтобы увеличить шансы обнаружения эДНК. Это исследование поможет улучшить понимание учеными того, как электронная ДНК может быть использована для мониторинга и сохранения водного биоразнообразия.

Исследование проводилось в сотрудничестве между исследователями из британского Лондонского университета Королевы Марии и следующих канадских учреждений: Университета Макгилла, Университета Лейкхед, IISD Experimental Lakes Area и SHARCNET. Во время исследования доктор Литтлфэйр работал в Университете Макгилла, а затем в QMUL.