Нарушение регуляции R-петлей может привести к остановке репликационных вилок и нестабильности теломер. Однако то, как R-петли распознаются и регулируются, до сих пор не совсем понятно, особенно в теломерах.

В новом исследовании ученые использовали технологию идентификации биотина, зависящую от близости (BioID), для идентификации интерактома ILF3 и обнаружили, что ILF3 взаимодействует с несколькими ДНК/РНК-хеликазами, включая DHX9. Это взаимодействие предполагает, что ILF3 может способствовать разрешению теломерных R-петлей, тем самым предотвращая аномальную гомологичную рекомбинацию и поддерживая гомеостаз теломер.

Работа под названием «ILF3 защищает теломеры от аберрантной гомологичной рекомбинации в качестве теломерного считывателя R-петли» была опубликована в журнале Белок и клетка.

Ключевые выводы исследования включают в себя:

1. ILF3 избирательно взаимодействует с теломерными R-петлями, тем самым защищая теломеры от аберрантной гомологичной рекомбинации.
2. Потеря функции ILF3, следовательно, повышает уровни TERRA, вызывая накопление R-петлей на теломерах. Это накопление вызывает реакцию повреждения ДНК (DDR) и дисфункцию теломер, характеризующуюся повышенным уровнем TIF, хрупкостью теломер и наличием внехромосомных фрагментов теломер, которые, в свою очередь, могут активировать путь АЛТ.
3. Кроме того, картирование интерактома ILF3 выявило взаимодействие с различными ДНК/РНК-хеликазами, включая DHX9, что существенно указывает на то, что ILF3 потенциально помогает в разрешении теломерных R-петлей посредством его взаимодействия с DHX9.
4. ILF3 потенциально действует как считыватель теломерных R-петлей, помогая предотвратить аберрантную гомологичную рекомбинацию и поддерживать гомеостаз теломер.

Эти результаты подтверждают, что ILF3 взаимодействует с теломерными гибридными структурами РНК:ДНК, такими как R-петли, и способствует разрешению или ингибирует чрезмерное накопление R-петлей посредством РНК-хеликазы DHX9.

Это исследование дает новое представление о регуляции теломерных R-петлей и механизмах, поддерживающих гомеостаз теломер, что имеет значение для биологии старения.