Служба сельскохозяйственных исследований Министерства сельского хозяйства США (USDA-ARS) объявила, что исследователи реклассифицировали количество штаммов вируса африканской чумы свиней (АЧС) с 25 до шести уникальных генотипов. Это научное нововведение может помочь по-новому определить, как исследователи АЧС по всему миру классифицируют изоляты вируса АЧС (АЧС), и может облегчить ученым разработку вакцин, соответствующих различным штаммам, циркулирующим в эндемичных по АЧС районах по всему миру.

Работа опубликована в журнале Вирусы.

«Ранее во всем мире было идентифицировано 25 различных генотипов вируса», — сказал старший научный сотрудник ARS Дуглас Глэдью. «Наша исследовательская группа недавно провела повторную оценку всех общедоступных последовательностей ДНК вируса и обнаружила, что большинство генотипов (генетического состава), первоначально идентифицированных как новые, не были правильно идентифицированы и не сравнивались с уже существующими генотипами вируса АЧС. На основании этого анализа существуют на самом деле уникальных генотипов меньше, чем предполагало исследовательское сообщество АЧС, а это означает, что существует меньшее разнообразие вируса АЧС, поражающего сообщества по всему миру. .»

Точная классификация вирусов имеет первостепенное значение для эпидемиологических исследований и разработки экономически эффективных контрмер, включая разработку вакцин для уникальных штаммов вируса АЧС.

В ходе этой крупномасштабной работы исследователи ARS повторно проанализировали более 12 000 исторических и текущих изолятов вируса, полученных в лабораториях вируса АЧС по всему миру. Эти усилия стали возможными благодаря использованию вычислительных мощностей SciNet, суперкомпьютерного кластера ARS для решения проблем с большими данными в сельском хозяйстве.

Хотя вирус АЧС наносит огромный экономический ущерб мировой свиноводческой отрасли, в Соединенных Штатах не было никаких вспышек. Высококонтагиозный вирус АЧС распространился из Африки в Республику Грузия в 2007 году и с тех пор распространился по Европе, Доминиканской Республике и Азии, прежде чем достичь Южной Африки в начале 2023 года. Вирус не может передаваться от свиней к человеку.

Это исследование включает в себя вклад в исследования и разработки Национального фонда биологической и агрозащиты, Канадского агентства по контролю за продовольствием и инспекциями и Университета Макерере в Уганде.